Aniversário São Borja é 11 de março.
Data da Emancipação: 21/05/1834.
Quem nasce ou mora no município de São Borja chama-se: SÃOBORJENSE.
Expulsos os jesuítas das missões orientais, a elas retornaram em 1639. Nessa segunda fase de atividades, fundam o povo de São Francisco de Borja, daí o nome que, abrigando a população indígena das regiões situadas entre o Icamaquã e o Butuí, bem como a da margem Argentina, chegou a possuir quase 4000 habitantes. Nessa época, foi designado um Comandante Geral das Missões, função que deveria ser exercida por um oficial superior do exército. Os primeiros comandantes gerais exerceram suas funções em São Miguel, São Nicolau, São Luiz e só posteriormente em São Borja. No entanto, cada dia mais evidenciava-se que urgia integrar efetivamente a vasta área das Missões, quase a metade do atual Rio Grande, bem como dar às novas fronteiras uma eficiente proteção.
Tudo isso talvez tenha levado, em 1833, o Presidente da Província, em conselho, a criar a Comarca das Missões, da qual um dos termos sediava-se em São Borja. Para a instalação do referido termo de comarca foi o povoado, nesse mesmo ano e por decisão do mesmo Presidente da Província em Conselho, elevado à vila.
Sua história continuaria conturbada por repetidas lutas, já que por sua própria situação geográfica, participara ativamente de todas as contendas com os países vizinhos. Apesar de tudo, São Borja prosperou graças, principalmente, à pecuária que constitui até hoje a base de sua economia.
São Borja é uma das cidades gaúchas mais embebidas na história do Estado.
Fundada em 1682, pelo jesuíta Francisco Garcia, como o primeiro dos Sete Povos das Missões, notabilizou-se como ponto estratégico na Guerra do Paraguai e ganhou dimensão nacional principalmente por ter sido o berço, e por abrigar os túmulos de dois ex-presidentes, Getúlio Vargas e João Goulart. Em 1954, ano importante por ter sido o da morte de Getúlio, o município de São Borja se caracterizava por abrigar um rebanho bovino de 363 mil animais e um ovino de 212 mil cabeças, base de sua economia. Nome anterior: São Francisco de Borja.
Município mãe: Rio Pardo.